Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQR7

Psenen, Gamma-secretase subunit PEN-2, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PsenenQ9CQR7 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PsenenQ9CQR7 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PsenenQ9CQR7 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
PsenenQ9CQR7 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PsenenQ9CQR7 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PsenenQ9CQR7 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
PsenenQ9CQR7 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
PsenenQ9CQR7 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PsenenQ9CQR7 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
PsenenQ9CQR7 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PsenenQ9CQR7 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
PsenenQ9CQR7 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PsenenQ9CQR7 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PsenenQ9CQR7 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PsenenQ9CQR7 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
PsenenQ9CQR7 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PsenenQ9CQR7 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PsenenQ9CQR7 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PsenenQ9CQR7 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
PsenenQ9CQR7 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
PsenenQ9CQR7 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PsenenQ9CQR7 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PsenenQ9CQR7 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PsenenQ9CQR7 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PsenenQ9CQR7 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PsenenQ9CQR7 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PsenenQ9CQR7 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PsenenQ9CQR7 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PsenenQ9CQR7 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PsenenQ9CQR7 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PsenenQ9CQR7 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PsenenQ9CQR7 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PsenenQ9CQR7 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PsenenQ9CQR7 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PsenenQ9CQR7 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PsenenQ9CQR7 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PsenenQ9CQR7 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PsenenQ9CQR7 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PsenenQ9CQR7 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PsenenQ9CQR7 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PsenenQ9CQR7 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PsenenQ9CQR7 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PsenenQ9CQR7 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PsenenQ9CQR7 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PsenenQ9CQR7 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PsenenQ9CQR7 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PsenenQ9CQR7 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PsenenQ9CQR7 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PsenenQ9CQR7 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PsenenQ9CQR7 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PsenenQ9CQR7 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PsenenQ9CQR7 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PsenenQ9CQR7 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PsenenQ9CQR7 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PsenenQ9CQR7 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PsenenQ9CQR7 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PsenenQ9CQR7 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PsenenQ9CQR7 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PsenenQ9CQR7 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PsenenQ9CQR7 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PsenenQ9CQR7 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PsenenQ9CQR7 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PsenenQ9CQR7 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PsenenQ9CQR7 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PsenenQ9CQR7 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PsenenQ9CQR7 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PsenenQ9CQR7 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PsenenQ9CQR7 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PsenenQ9CQR7 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PsenenQ9CQR7 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PsenenQ9CQR7 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PsenenQ9CQR7 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PsenenQ9CQR7 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PsenenQ9CQR7 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PsenenQ9CQR7 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PsenenQ9CQR7 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PsenenQ9CQR7 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PsenenQ9CQR7 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PsenenQ9CQR7 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PsenenQ9CQR7 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PsenenQ9CQR7 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PsenenQ9CQR7 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PsenenQ9CQR7 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PsenenQ9CQR7 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PsenenQ9CQR7 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PsenenQ9CQR7 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PsenenQ9CQR7 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PsenenQ9CQR7 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PsenenQ9CQR7 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PsenenQ9CQR7 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PsenenQ9CQR7 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
PsenenQ9CQR7 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PsenenQ9CQR7 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PsenenQ9CQR7 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
PsenenQ9CQR7 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PsenenQ9CQR7 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PsenenQ9CQR7 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PsenenQ9CQR7 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PsenenQ9CQR7 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PsenenQ9CQR7 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms