Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Atp6v0e1Q9CQD8 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Atp6v0e1Q9CQD8 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Atp6v0e1Q9CQD8 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Atp6v0e1Q9CQD8 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Atp6v0e1Q9CQD8 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Atp6v0e1Q9CQD8 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Atp6v0e1Q9CQD8 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Atp6v0e1Q9CQD8 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Atp6v0e1Q9CQD8 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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