Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Rab5aQ9CQD1 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Rab5aQ9CQD1 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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