Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ46

Efcab2, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 164 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcab2Q9CQ46 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efcab2Q9CQ46 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Efcab2Q9CQ46 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Efcab2Q9CQ46 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Efcab2Q9CQ46 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Efcab2Q9CQ46 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efcab2Q9CQ46 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efcab2Q9CQ46 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efcab2Q9CQ46 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efcab2Q9CQ46 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efcab2Q9CQ46 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efcab2Q9CQ46 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efcab2Q9CQ46 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efcab2Q9CQ46 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efcab2Q9CQ46 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efcab2Q9CQ46 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efcab2Q9CQ46 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efcab2Q9CQ46 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efcab2Q9CQ46 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efcab2Q9CQ46 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efcab2Q9CQ46 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efcab2Q9CQ46 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Efcab2Q9CQ46 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efcab2Q9CQ46 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efcab2Q9CQ46 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efcab2Q9CQ46 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efcab2Q9CQ46 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efcab2Q9CQ46 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efcab2Q9CQ46 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efcab2Q9CQ46 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Efcab2Q9CQ46 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efcab2Q9CQ46 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efcab2Q9CQ46 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Efcab2Q9CQ46 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Efcab2Q9CQ46 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Efcab2Q9CQ46 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Efcab2Q9CQ46 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efcab2Q9CQ46 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efcab2Q9CQ46 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efcab2Q9CQ46 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Efcab2Q9CQ46 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efcab2Q9CQ46 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Efcab2Q9CQ46 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efcab2Q9CQ46 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efcab2Q9CQ46 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efcab2Q9CQ46 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efcab2Q9CQ46 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efcab2Q9CQ46 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efcab2Q9CQ46 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efcab2Q9CQ46 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efcab2Q9CQ46 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Efcab2Q9CQ46 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Efcab2Q9CQ46 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Efcab2Q9CQ46 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efcab2Q9CQ46 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Efcab2Q9CQ46 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Efcab2Q9CQ46 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efcab2Q9CQ46 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Efcab2Q9CQ46 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efcab2Q9CQ46 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Efcab2Q9CQ46 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Efcab2Q9CQ46 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Efcab2Q9CQ46 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efcab2Q9CQ46 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efcab2Q9CQ46 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efcab2Q9CQ46 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efcab2Q9CQ46 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efcab2Q9CQ46 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efcab2Q9CQ46 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efcab2Q9CQ46 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efcab2Q9CQ46 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms