Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms