Protein–RNA interactions for Protein: Q99PS0

Krt23, Keratin, type I cytoskeletal 23, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt23Q99PS0 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt23Q99PS0 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt23Q99PS0 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt23Q99PS0 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt23Q99PS0 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt23Q99PS0 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt23Q99PS0 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt23Q99PS0 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt23Q99PS0 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt23Q99PS0 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt23Q99PS0 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt23Q99PS0 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt23Q99PS0 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt23Q99PS0 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt23Q99PS0 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt23Q99PS0 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt23Q99PS0 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt23Q99PS0 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt23Q99PS0 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt23Q99PS0 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt23Q99PS0 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt23Q99PS0 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt23Q99PS0 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt23Q99PS0 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt23Q99PS0 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt23Q99PS0 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt23Q99PS0 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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Krt23Q99PS0 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt23Q99PS0 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt23Q99PS0 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt23Q99PS0 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt23Q99PS0 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt23Q99PS0 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt23Q99PS0 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt23Q99PS0 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt23Q99PS0 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt23Q99PS0 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt23Q99PS0 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt23Q99PS0 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt23Q99PS0 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt23Q99PS0 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt23Q99PS0 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt23Q99PS0 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt23Q99PS0 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt23Q99PS0 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt23Q99PS0 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt23Q99PS0 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt23Q99PS0 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt23Q99PS0 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt23Q99PS0 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt23Q99PS0 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt23Q99PS0 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Krt23Q99PS0 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt23Q99PS0 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt23Q99PS0 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt23Q99PS0 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt23Q99PS0 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt23Q99PS0 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Krt23Q99PS0 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Krt23Q99PS0 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt23Q99PS0 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Krt23Q99PS0 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt23Q99PS0 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt23Q99PS0 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt23Q99PS0 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt23Q99PS0 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt23Q99PS0 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt23Q99PS0 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt23Q99PS0 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt23Q99PS0 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt23Q99PS0 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt23Q99PS0 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt23Q99PS0 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt23Q99PS0 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt23Q99PS0 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt23Q99PS0 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt23Q99PS0 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt23Q99PS0 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt23Q99PS0 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt23Q99PS0 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt23Q99PS0 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt23Q99PS0 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt23Q99PS0 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt23Q99PS0 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt23Q99PS0 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt23Q99PS0 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt23Q99PS0 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt23Q99PS0 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt23Q99PS0 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt23Q99PS0 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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