Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NsmfQ99NF2 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
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NsmfQ99NF2 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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