Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms