Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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PtprtQ99M80 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
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PtprtQ99M80 Gm37782-201ENSMUST00000194879 678 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
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PtprtQ99M80 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
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PtprtQ99M80 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Gm20773-202ENSMUST00000193306 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Atp5s-204ENSMUST00000220916 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Gm6331-201ENSMUST00000217890 450 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Gm14717-201ENSMUST00000140450 649 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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PtprtQ99M80 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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PtprtQ99M80 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Gm12676-201ENSMUST00000149078 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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