Protein–RNA interactions for Protein: Q99M71

Epdr1, Mammalian ependymin-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epdr1Q99M71 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Epdr1Q99M71 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms