Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3bp5lQ99LH9 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3bp5lQ99LH9 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3bp5lQ99LH9 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3bp5lQ99LH9 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3bp5lQ99LH9 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3bp5lQ99LH9 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3bp5lQ99LH9 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3bp5lQ99LH9 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sh3bp5lQ99LH9 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sh3bp5lQ99LH9 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sh3bp5lQ99LH9 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3bp5lQ99LH9 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3bp5lQ99LH9 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3bp5lQ99LH9 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3bp5lQ99LH9 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3bp5lQ99LH9 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3bp5lQ99LH9 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sh3bp5lQ99LH9 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3bp5lQ99LH9 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sh3bp5lQ99LH9 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sh3bp5lQ99LH9 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sh3bp5lQ99LH9 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3bp5lQ99LH9 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3bp5lQ99LH9 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3bp5lQ99LH9 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3bp5lQ99LH9 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3bp5lQ99LH9 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3bp5lQ99LH9 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3bp5lQ99LH9 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3bp5lQ99LH9 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3bp5lQ99LH9 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3bp5lQ99LH9 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3bp5lQ99LH9 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3bp5lQ99LH9 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3bp5lQ99LH9 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3bp5lQ99LH9 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3bp5lQ99LH9 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3bp5lQ99LH9 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3bp5lQ99LH9 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3bp5lQ99LH9 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3bp5lQ99LH9 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3bp5lQ99LH9 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3bp5lQ99LH9 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3bp5lQ99LH9 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sh3bp5lQ99LH9 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3bp5lQ99LH9 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3bp5lQ99LH9 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3bp5lQ99LH9 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3bp5lQ99LH9 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3bp5lQ99LH9 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3bp5lQ99LH9 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3bp5lQ99LH9 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3bp5lQ99LH9 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3bp5lQ99LH9 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3bp5lQ99LH9 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3bp5lQ99LH9 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3bp5lQ99LH9 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3bp5lQ99LH9 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3bp5lQ99LH9 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sh3bp5lQ99LH9 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3bp5lQ99LH9 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3bp5lQ99LH9 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3bp5lQ99LH9 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3bp5lQ99LH9 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3bp5lQ99LH9 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3bp5lQ99LH9 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3bp5lQ99LH9 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3bp5lQ99LH9 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh3bp5lQ99LH9 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh3bp5lQ99LH9 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sh3bp5lQ99LH9 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh3bp5lQ99LH9 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sh3bp5lQ99LH9 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh3bp5lQ99LH9 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sh3bp5lQ99LH9 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sh3bp5lQ99LH9 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms