Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hps4Q99KG7 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms