Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmed9Q99KF1 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmed9Q99KF1 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmed9Q99KF1 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmed9Q99KF1 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmed9Q99KF1 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmed9Q99KF1 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmed9Q99KF1 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmed9Q99KF1 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmed9Q99KF1 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmed9Q99KF1 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmed9Q99KF1 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmed9Q99KF1 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmed9Q99KF1 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmed9Q99KF1 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmed9Q99KF1 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmed9Q99KF1 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmed9Q99KF1 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmed9Q99KF1 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmed9Q99KF1 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmed9Q99KF1 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed9Q99KF1 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed9Q99KF1 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed9Q99KF1 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed9Q99KF1 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed9Q99KF1 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed9Q99KF1 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed9Q99KF1 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed9Q99KF1 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed9Q99KF1 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed9Q99KF1 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed9Q99KF1 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed9Q99KF1 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed9Q99KF1 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed9Q99KF1 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed9Q99KF1 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed9Q99KF1 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed9Q99KF1 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed9Q99KF1 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed9Q99KF1 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed9Q99KF1 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed9Q99KF1 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed9Q99KF1 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed9Q99KF1 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed9Q99KF1 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed9Q99KF1 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed9Q99KF1 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed9Q99KF1 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed9Q99KF1 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed9Q99KF1 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed9Q99KF1 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed9Q99KF1 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed9Q99KF1 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed9Q99KF1 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed9Q99KF1 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed9Q99KF1 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed9Q99KF1 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed9Q99KF1 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed9Q99KF1 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed9Q99KF1 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed9Q99KF1 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed9Q99KF1 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed9Q99KF1 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed9Q99KF1 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed9Q99KF1 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed9Q99KF1 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed9Q99KF1 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed9Q99KF1 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed9Q99KF1 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed9Q99KF1 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed9Q99KF1 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed9Q99KF1 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed9Q99KF1 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed9Q99KF1 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed9Q99KF1 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed9Q99KF1 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed9Q99KF1 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms