Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms