Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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