Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Ctu1Q99J10 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
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Ctu1Q99J10 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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