Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
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Cldn16Q925N4 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Cldn16Q925N4 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
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Cldn16Q925N4 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Cldn16Q925N4 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Cldn16Q925N4 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms