Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms