Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms