Protein–RNA interactions for Protein: Q922L6

Nelfcd, Negative elongation factor D, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfcdQ922L6 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NelfcdQ922L6 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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