Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Gm24541-201ENSMUST00000103871 96 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Gm38018-201ENSMUST00000195651 540 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Speer4f2-201ENSMUST00000166086 1278 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Gm25025-201ENSMUST00000175018 111 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp3Q91W36 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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