Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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