Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Slc6a20aQ8VDB9 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Slc6a20aQ8VDB9 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Slc6a20aQ8VDB9 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Slc6a20aQ8VDB9 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Slc6a20aQ8VDB9 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Slc6a20aQ8VDB9 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Slc6a20aQ8VDB9 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Slc6a20aQ8VDB9 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Slc6a20aQ8VDB9 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Slc6a20aQ8VDB9 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Slc6a20aQ8VDB9 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Slc6a20aQ8VDB9 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Slc6a20aQ8VDB9 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Slc6a20aQ8VDB9 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Slc6a20aQ8VDB9 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Slc6a20aQ8VDB9 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Slc6a20aQ8VDB9 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Slc6a20aQ8VDB9 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Slc6a20aQ8VDB9 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Slc6a20aQ8VDB9 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Slc6a20aQ8VDB9 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Slc6a20aQ8VDB9 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Slc6a20aQ8VDB9 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Slc6a20aQ8VDB9 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Slc6a20aQ8VDB9 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Slc6a20aQ8VDB9 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Slc6a20aQ8VDB9 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Slc6a20aQ8VDB9 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Slc6a20aQ8VDB9 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Slc6a20aQ8VDB9 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Slc6a20aQ8VDB9 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Slc6a20aQ8VDB9 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Slc6a20aQ8VDB9 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Slc6a20aQ8VDB9 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Slc6a20aQ8VDB9 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Slc6a20aQ8VDB9 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Slc6a20aQ8VDB9 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Slc6a20aQ8VDB9 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Slc6a20aQ8VDB9 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Slc6a20aQ8VDB9 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Slc6a20aQ8VDB9 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Slc6a20aQ8VDB9 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Slc6a20aQ8VDB9 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Slc6a20aQ8VDB9 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Slc6a20aQ8VDB9 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Slc6a20aQ8VDB9 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Slc6a20aQ8VDB9 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Slc6a20aQ8VDB9 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Slc6a20aQ8VDB9 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Slc6a20aQ8VDB9 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Slc6a20aQ8VDB9 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Slc6a20aQ8VDB9 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc6a20aQ8VDB9 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Slc6a20aQ8VDB9 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc6a20aQ8VDB9 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc6a20aQ8VDB9 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc6a20aQ8VDB9 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc6a20aQ8VDB9 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc6a20aQ8VDB9 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc6a20aQ8VDB9 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc6a20aQ8VDB9 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc6a20aQ8VDB9 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc6a20aQ8VDB9 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc6a20aQ8VDB9 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc6a20aQ8VDB9 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc6a20aQ8VDB9 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc6a20aQ8VDB9 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc6a20aQ8VDB9 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Slc6a20aQ8VDB9 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc6a20aQ8VDB9 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc6a20aQ8VDB9 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc6a20aQ8VDB9 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc6a20aQ8VDB9 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc6a20aQ8VDB9 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
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