Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD57

Sft2d2, Vesicle transport protein SFT2B, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d2Q8VD57 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms