Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Top1mtQ8R4U6 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Top1mtQ8R4U6 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Top1mtQ8R4U6 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Top1mtQ8R4U6 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Top1mtQ8R4U6 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Top1mtQ8R4U6 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Top1mtQ8R4U6 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Top1mtQ8R4U6 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Top1mtQ8R4U6 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Top1mtQ8R4U6 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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