Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4J6

Mkl1, MKL/myocardin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 964 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkl1Q8K4J6 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mkl1Q8K4J6 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mkl1Q8K4J6 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mkl1Q8K4J6 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mkl1Q8K4J6 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mkl1Q8K4J6 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mkl1Q8K4J6 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mkl1Q8K4J6 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mkl1Q8K4J6 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mkl1Q8K4J6 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mkl1Q8K4J6 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mkl1Q8K4J6 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mkl1Q8K4J6 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Mkl1Q8K4J6 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.4 ms