Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Fcho1Q8K285 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcho1Q8K285 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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