Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn34c1Q8K193 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn34c1Q8K193 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn34c1Q8K193 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn34c1Q8K193 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn34c1Q8K193 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn34c1Q8K193 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn34c1Q8K193 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn34c1Q8K193 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn34c1Q8K193 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn34c1Q8K193 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn34c1Q8K193 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn34c1Q8K193 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn34c1Q8K193 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn34c1Q8K193 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn34c1Q8K193 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn34c1Q8K193 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn34c1Q8K193 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn34c1Q8K193 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn34c1Q8K193 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn34c1Q8K193 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn34c1Q8K193 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn34c1Q8K193 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn34c1Q8K193 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn34c1Q8K193 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn34c1Q8K193 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn34c1Q8K193 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn34c1Q8K193 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn34c1Q8K193 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn34c1Q8K193 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn34c1Q8K193 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn34c1Q8K193 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn34c1Q8K193 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn34c1Q8K193 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn34c1Q8K193 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn34c1Q8K193 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn34c1Q8K193 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn34c1Q8K193 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn34c1Q8K193 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cldn34c1Q8K193 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cldn34c1Q8K193 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cldn34c1Q8K193 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cldn34c1Q8K193 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms