Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FgbQ8K0E8 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms