Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rasgef1bQ8JZL7 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rasgef1bQ8JZL7 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rasgef1bQ8JZL7 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rasgef1bQ8JZL7 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Rasgef1bQ8JZL7 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
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Rasgef1bQ8JZL7 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Rasgef1bQ8JZL7 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Rasgef1bQ8JZL7 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Rasgef1bQ8JZL7 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rasgef1bQ8JZL7 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Rasgef1bQ8JZL7 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms