Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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