Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nup88Q8CEC0 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms