Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Pramef8Q8CE24 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Pramef8Q8CE24 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Pramef8Q8CE24 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Pramef8Q8CE24 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Pramef8Q8CE24 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
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Pramef8Q8CE24 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Pramef8Q8CE24 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Pramef8Q8CE24 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Pramef8Q8CE24 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pramef8Q8CE24 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms