Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD19

Lancl3, LanC-like protein 3, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl3Q8CD19 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lancl3Q8CD19 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lancl3Q8CD19 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lancl3Q8CD19 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lancl3Q8CD19 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lancl3Q8CD19 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lancl3Q8CD19 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Lancl3Q8CD19 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lancl3Q8CD19 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lancl3Q8CD19 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lancl3Q8CD19 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lancl3Q8CD19 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lancl3Q8CD19 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lancl3Q8CD19 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Lancl3Q8CD19 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lancl3Q8CD19 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lancl3Q8CD19 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lancl3Q8CD19 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Lancl3Q8CD19 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lancl3Q8CD19 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lancl3Q8CD19 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Lancl3Q8CD19 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Lancl3Q8CD19 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lancl3Q8CD19 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lancl3Q8CD19 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lancl3Q8CD19 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Lancl3Q8CD19 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Lancl3Q8CD19 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Lancl3Q8CD19 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Lancl3Q8CD19 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Lancl3Q8CD19 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Lancl3Q8CD19 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lancl3Q8CD19 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lancl3Q8CD19 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Lancl3Q8CD19 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Lancl3Q8CD19 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Lancl3Q8CD19 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lancl3Q8CD19 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Lancl3Q8CD19 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lancl3Q8CD19 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lancl3Q8CD19 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lancl3Q8CD19 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lancl3Q8CD19 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lancl3Q8CD19 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lancl3Q8CD19 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lancl3Q8CD19 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lancl3Q8CD19 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lancl3Q8CD19 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lancl3Q8CD19 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lancl3Q8CD19 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lancl3Q8CD19 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lancl3Q8CD19 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lancl3Q8CD19 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lancl3Q8CD19 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lancl3Q8CD19 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lancl3Q8CD19 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lancl3Q8CD19 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lancl3Q8CD19 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lancl3Q8CD19 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Lancl3Q8CD19 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lancl3Q8CD19 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lancl3Q8CD19 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms