Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms