Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3Q8C5U9 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms