Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms