Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms