Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg16l1Q8C0J2 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg16l1Q8C0J2 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg16l1Q8C0J2 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg16l1Q8C0J2 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg16l1Q8C0J2 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg16l1Q8C0J2 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg16l1Q8C0J2 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg16l1Q8C0J2 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg16l1Q8C0J2 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg16l1Q8C0J2 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg16l1Q8C0J2 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg16l1Q8C0J2 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg16l1Q8C0J2 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg16l1Q8C0J2 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Atg16l1Q8C0J2 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg16l1Q8C0J2 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Atg16l1Q8C0J2 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg16l1Q8C0J2 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg16l1Q8C0J2 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg16l1Q8C0J2 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Atg16l1Q8C0J2 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg16l1Q8C0J2 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg16l1Q8C0J2 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg16l1Q8C0J2 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg16l1Q8C0J2 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg16l1Q8C0J2 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg16l1Q8C0J2 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Atg16l1Q8C0J2 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg16l1Q8C0J2 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg16l1Q8C0J2 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Atg16l1Q8C0J2 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Atg16l1Q8C0J2 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Atg16l1Q8C0J2 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atg16l1Q8C0J2 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atg16l1Q8C0J2 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Atg16l1Q8C0J2 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atg16l1Q8C0J2 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atg16l1Q8C0J2 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atg16l1Q8C0J2 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atg16l1Q8C0J2 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atg16l1Q8C0J2 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atg16l1Q8C0J2 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atg16l1Q8C0J2 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atg16l1Q8C0J2 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atg16l1Q8C0J2 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atg16l1Q8C0J2 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atg16l1Q8C0J2 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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