Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
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FarsaQ8C0C7 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
FarsaQ8C0C7 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FarsaQ8C0C7 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
FarsaQ8C0C7 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
FarsaQ8C0C7 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
FarsaQ8C0C7 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
FarsaQ8C0C7 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
FarsaQ8C0C7 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
FarsaQ8C0C7 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
FarsaQ8C0C7 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
FarsaQ8C0C7 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
FarsaQ8C0C7 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
FarsaQ8C0C7 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FarsaQ8C0C7 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
FarsaQ8C0C7 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FarsaQ8C0C7 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
FarsaQ8C0C7 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FarsaQ8C0C7 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FarsaQ8C0C7 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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FarsaQ8C0C7 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
FarsaQ8C0C7 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FarsaQ8C0C7 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
FarsaQ8C0C7 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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FarsaQ8C0C7 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FarsaQ8C0C7 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FarsaQ8C0C7 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FarsaQ8C0C7 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FarsaQ8C0C7 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FarsaQ8C0C7 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FarsaQ8C0C7 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FarsaQ8C0C7 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
FarsaQ8C0C7 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FarsaQ8C0C7 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
FarsaQ8C0C7 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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FarsaQ8C0C7 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
FarsaQ8C0C7 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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FarsaQ8C0C7 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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FarsaQ8C0C7 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
FarsaQ8C0C7 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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FarsaQ8C0C7 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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FarsaQ8C0C7 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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FarsaQ8C0C7 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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FarsaQ8C0C7 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
FarsaQ8C0C7 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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FarsaQ8C0C7 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
FarsaQ8C0C7 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
FarsaQ8C0C7 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
FarsaQ8C0C7 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
FarsaQ8C0C7 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
FarsaQ8C0C7 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
FarsaQ8C0C7 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
FarsaQ8C0C7 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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FarsaQ8C0C7 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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FarsaQ8C0C7 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
FarsaQ8C0C7 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
FarsaQ8C0C7 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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FarsaQ8C0C7 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
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