Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms