Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms