Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Usp38Q8BW70 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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