Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
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Pdcl3Q8BVF2 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Pdcl3Q8BVF2 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Pdcl3Q8BVF2 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Pdcl3Q8BVF2 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Pdcl3Q8BVF2 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Pdcl3Q8BVF2 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Pdcl3Q8BVF2 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Pdcl3Q8BVF2 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Pdcl3Q8BVF2 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Pdcl3Q8BVF2 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Pdcl3Q8BVF2 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Pdcl3Q8BVF2 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Pdcl3Q8BVF2 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Pdcl3Q8BVF2 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Pdcl3Q8BVF2 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
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