Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubash3bQ8BGG7 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms