Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE7

Trim6, Tripartite motif-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim6Q8BGE7 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim6Q8BGE7 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim6Q8BGE7 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim6Q8BGE7 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim6Q8BGE7 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim6Q8BGE7 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim6Q8BGE7 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim6Q8BGE7 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim6Q8BGE7 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim6Q8BGE7 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim6Q8BGE7 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim6Q8BGE7 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim6Q8BGE7 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim6Q8BGE7 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim6Q8BGE7 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim6Q8BGE7 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim6Q8BGE7 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim6Q8BGE7 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim6Q8BGE7 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim6Q8BGE7 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim6Q8BGE7 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim6Q8BGE7 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim6Q8BGE7 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim6Q8BGE7 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim6Q8BGE7 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim6Q8BGE7 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim6Q8BGE7 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim6Q8BGE7 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim6Q8BGE7 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim6Q8BGE7 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim6Q8BGE7 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim6Q8BGE7 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim6Q8BGE7 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim6Q8BGE7 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim6Q8BGE7 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim6Q8BGE7 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim6Q8BGE7 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim6Q8BGE7 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim6Q8BGE7 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim6Q8BGE7 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trim6Q8BGE7 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trim6Q8BGE7 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trim6Q8BGE7 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trim6Q8BGE7 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim6Q8BGE7 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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