Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Smim19Q80ZU4 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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