Protein–RNA interactions for Protein: Q80W85

Npm2, Nucleoplasmin-2, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm2Q80W85 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Npm2Q80W85 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms