Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nphp3Q7TNH6 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.8 ms