Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Sys1Q78S06 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Sys1Q78S06 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Sys1Q78S06 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Sys1Q78S06 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sys1Q78S06 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sys1Q78S06 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sys1Q78S06 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sys1Q78S06 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Sys1Q78S06 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sys1Q78S06 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sys1Q78S06 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sys1Q78S06 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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